trinetx
TriNetX es una empresa comercial que, junto con Stony Brook Medicine, respalda consultas para el descubrimiento de cohortes y preguntas básicas sobre COVID-19. Esta plataforma admite una elegante interfaz interactiva que permite a cualquier persona con una cuenta de Stony Brook Medicine interrogar los datos del paciente de COVID-19 de una manera que no requiere la aprobación del IRB para verlos, ya que los datos están desidentificados. Los datos también se pueden descargar en una forma anónima, lo que requiere el reconocimiento del IRB, y los datos identificados se pueden obtener con la aprobación del IRB. Los datos de TriNetX son muy buenos y se aproximan mucho a la información de Data Commons; sin embargo, no está cuidadosamente curado y no contiene todos los mismos elementos. Si bien es muy útil, los datos de TriNetX no reemplazan la necesidad de Data Commons.
Obtenga más información sobre TriNetX, incluida la información de capacitación, el acceso y las preguntas frecuentes. https://www.stonybrookmedicine.edu/trinetx
Datos comunes
Para ayudar a los investigadores en un interrogatorio rápido y confiable de la cohorte de pacientes COVID-19, Data Commons contiene un conjunto editado muy bien curado de más de 1,700 elementos de datos seleccionados por su relevancia clínica en esta población. La información disponible incluye información pertinente extraída a mano, así como datos de salud electrónicos validados (HCE) y cubre una variedad de posibles temas clínicos, por ejemplo, datos demográficos que incluyen etnia, presentación clínica, comorbilidades, estado de anticoagulación, insuficiencia renal aguda lesión, ventilación mecánica, por nombrar algunas de las casi 2000 variables disponibles. Este recurso está disponible para los profesores y el personal de Stony Brook, después de obtener la aprobación del DAC, tanto para iniciativas de calidad como para investigación. https://stonybrookmedicine.app.box.com/file/666659622637?s=dogv0fuhkfl4k4r5djl8pn3ayrczegjf. Este conjunto de datos está creciendo a medida que el equipo de Informática Biomédica trabaja con grupos de investigación para identificar y examinar elementos de datos adicionales. Por ejemplo, la información se está ampliando actualmente con datos de cultivo integrados de SunQuest, el sistema de información de patología, que actualmente no está integrado con Cerner Millenium, nuestro Stony Brook EHR.
Para acelerar el ritmo de la investigación asociada con Stony Brook Medicine COVID-19 Data Commons, se ha desarrollado un sitio web interno y seguro (covidexplorer.stonybrookmedicine.edu) destinado a explorar rápidamente los datos. Los investigadores aprobados pueden seleccionar fácilmente cohortes filtrando entre más de 2,000 criterios, o traer su propia cohorte cruzando una lista de números de registros médicos. Los investigadores pueden analizar rápidamente las relaciones entre hasta cuatro variables a la vez con herramientas gráficas integradas, o seleccionar un complemento más amplio de información para un análisis más sofisticado fuera de línea. Las herramientas del panel de control COVID-19 de Stony Brook Medicine también se implementarán pronto en el National COVID Cohort Collaborative (N3C).